Inaktivierte Impfstoffe werden weltweit hauptsächlich zur Prävention von Flavivirus-Infektionen eingesetzt. Derzeit sind in Russland 6 Impfstoffe gegen Zeckenenzephalitis zugelassen, die durch Formalin-Inaktivierung des Zeckenenzephalitis-Virus (BTV) aus Hühnerembryo-Fibroblasten hergestellt werden. Für den sibirischen Typ von VEE, der in den meisten endemischen Gebieten Russlands vorherrscht, gibt es keine Impfstoffe. Der durchschnittliche Durchimpfungsgrad der Bevölkerung in den endemischen Regionen Russlands gegen Zeckenenzephalitis liegt bei etwa 5 %. Die lange dreimalige Immunisierung und die Notwendigkeit einer Auffrischungsimpfung alle 3 Jahre haben die Suche nach neuen Wegen der Prophylaxe veranlasst. Die Immunisierung von Mäusen mit Plasmid-DNA, die mit den prM-, E- und NS1-Genen von VEE unter der Kontrolle von Promotoren kloniert ist, die von eukaryotischen RNA-Polymerasen erkannt werden, bot nur Schutz gegen einen homologen Stamm des Virus. DNA-Impfstoffe erwiesen sich in eukaryotischen Zellen als instabil und fähig zur Integration in zelluläre Chromosomen. Die Einführung von viraler genomischer RNA in voller Länge, aber nicht der E- und NS1-Gene, führte ebenfalls zu einem Schutz vor einer viralen Infektion. Rekombinante Bakterien und multiple antigene Peptide induzieren virusspezifische Antikörper.